早在明、清时期，鱼峰区已是柳州最大的农贸市场，1929年前，辖区内只有一些小工业，1929年2月，在鸡喇建成柳州机械厂，是广西当时最大型的机械工厂。抗日战争开始后，北方大批工商业主迁来柳州，在鱼峰辖区办起一批机械修理、铸造、汽车修理等企业，逐渐形成柳州的工业区。

2000年，鱼峰区辖6个街道。

2002年6月22日，国务院批准（国函〔2002〕57号）：撤销柳州市市郊区，将原郊区的羊角山镇的水南、驾鹤、鸡喇、社湾、阳和5个村和鸡喇居委会划归鱼峰区管辖；鱼峰区的潭中街道划归城中区管辖。

2005年7月，撤销鱼峰区羊角山镇，新设白莲、麒麟2个街道办事处。

2011年1月，广西壮族自治区政府批准同意调整柳州市鱼峰区和鹿寨县行政区划：将鹿寨县雒容镇整体划归柳州市鱼峰区管辖，此次区划调整后，鱼峰区行政区域面积扩大3倍。

2012年2月22日，广西壮族自治区政府批准同意调整柳州市鱼峰区和柳北区行政区划，将原柳州市柳北区洛埠镇整体划入柳州市鱼峰区管辖。

2018年5月11日，广西壮族自治区政府批准同意柳州市鱼峰区和柳江区行政区划，将原柳州市柳江区里雍镇、白沙镇整体划入柳州市鱼峰区管辖。